Yeşil mutabakata uyum kapsamında 2027 yılına kadar Türkiye su ürünleri avcılığı ve yetiştiriciliğindeki biyoçeşitliliğin korunması ve su ürünleri üretiminin gıda arzı güvenliği için sürdürülebilir hale getirilmesi için genomik, transkriptomik ve hücre hattı yöntem ve ürünlerin geliştirilmesi
Türkiye avcılık ve yetiştiriciliğinde önem arz eden 35 türün tüm genom dizilemelerin ve transkriptom analizlerinin yapılarak elde edilecek bilginin su ürünleri avcılığı ve yetiştiriciliğine yön verecek ve gıda arzı güvenliğini büyük ölçüde sürdürülebilir hale getirmeye katkıda bulunacak teknolojilerin geliştirilmesine zemin hazırlayacak biyoinformatik analizler ile işlenerek bilim dünyası ve özel sektörün kullanımına sunmaktır.
Bu genomik analizler tüm dünyada kabul görmüş ve yaygın olarak kullanılan Yeni Nesil Dizileme platformları olan yüksek doğruluklu kısa okumalar için Illumina ve validasyon için uzun okumalara sahip Nanopore platformları kullanılarak optimize edilecek yöntemler ile gerçekleştirilecektir. Nanopore platformu genomların tek parça okunarak Illumina platformundan gelecek kısa okumalar için kalıp oluşturulmasını sağlayacaktır. Bu şekilde hata oranı düşük genom ve transkriptom analizleri gerçekleştirilecektir. Ayrıca, ülkemizin su ekosistemlerindeki canlıların biyoçeşitliliğini korumak, insanlar tarafından tüketilen türlerin hücre tabanlı etlerini kültür ortamında üretmek ve bu sayede su ürünleri üretimine sürdürülebilir bir alternatif sağlamak amaçlanmıştır.
Genom ve transkriptom bilgilerinin platformda bulunan diğer projelere kaynak genetik bilgiyi sağlamak
Transkriptom analizleri ile türlerin yetiştiricilik için önemli verim ve direnç gizi özelliklerine ilişkin temel bilgileri oluşturması ile gelecekte kullanılacak genetik iyileştirme çalışmalarında Türkiye su ürünleri sektörünün gıda arzı güvenliğinde atılım yapabilmesinin altyapısını erkenden oluşturmak
Türkiye’nin ilk (yayınlanmış) genom verileri oluşturularak, bu verilerin açık erişime sahip olmasını sağlamak
Elde edilen transkriptomik ve genomik veriler ile aşı, hastalık tanı kiti, gıda bozulmalarında kullanılacak patojen tanı gibi ürünlerin geliştirilebilmesine olanak sağlamak
Platform kapsamında gerçekleştirilecek ve sonrasında ulusal/uluslararası diğer çalışmalarda Ar-Ge konusunda da öncü bir rol üstlenilmesini sağlamak
Türkiye avcılık ve yetiştiriciliğinde önem arz eden 35 türün tüm genom dizilemelerin ve transkriptom analizlerinin yapılarak elde edilecek bilginin su ürünleri avcılığı ve yetiştiriciliğine yön verecek ve gıda arzı güvenliğini büyük ölçüde sürdürülebilir hale getirmeye katkıda bulunacak teknolojilerin geliştirilmesine zemin hazırlayacak biyoinformatik analizler ile işlenerek bilim dünyası ve özel sektörün kullanımına sunmaktır.
Bu genomik analizler tüm dünyada kabul görmüş ve yaygın olarak kullanılan Yeni Nesil Dizileme platformları olan yüksek doğruluklu kısa okumalar için Illumina ve validasyon için uzun okumalar sahip Nanopore platformları kullanılarak optimize edilecek yöntemler ile gerçekleştirilecektir. Nanopore platformu genomların tek parça okunarak Illumina platformundan gelecek kısa okumalar için kalıp oluşturulmasını sağlayacaktır. Bu şekilde hata oranı düşük genom ve transkriptom analizleri gerçekleştirilecektir. Ayrıca, ülkemizin su ekosistemlerindeki canlıların biyoçeşitliliğini korumak, insanlar tarafından tüketilen türlerin hücre tabanlı etlerini kültür ortamında üretmek ve bu sayede su ürünleri üretimine sürdürülebilir bir alternatif sağlamak amaçlanmıştır.
Genom ve transkriptom bilgileri ile platformda bulunan diğer projelere kaynak genetik bilgiyi sağlamak
Transkriptom analizleri ile türlerin yetiştiricilik için önemli verim ve direnç gizi özelliklerine ilişkin temel bilgileri oluşturması ile gelecekte kullanılacak genetik iyileştirme çalışmalarında Türkiye su ürünleri sektörünün gıda arzı güvenliğinde atılım yapabilmesinin altyapısını erkenden oluşturmak
Türkiye’nin ilk (yayınlanmış) genom verileri oluşturularak, bu verilerin açık erişime sahip olmasını sağlamak
Elde edilen transkriptomik ve genomik veriler ile aşı, hastalık tanı kiti, gıda bozulmalarında kullanılacak patojen tanı gibi ürünlerin geliştirilebilmesine olanak sağlamak
Platform kapsamında gerçekleştirilecek ve sonrasında ulusal/uluslararası diğer çalışmalarda Ar-Ge konusunda da öncü bir rol üstlenilmesini sağlamak
| Unvan, Adı, Soyadı | Projedeki Görevi | Çalışmakta Olduğu Kurum/Kuruluş | |
| 1 | Doç. Dr. Emre KESKİN | Yürütücü | ASAUM |
| 2 | Doç. Dr. İsmail Kudret Sağlam | Araştırmacı | Koç Üniversitesi |
| 3 | Prof. Dr. İbrahim Raşit Bilgin | Araştırmacı | Boğaziçi Üniversitesi |
| 4 | Doç. Dr. Arzu Karahan | Araştırmacı | ODTÜ |
| 5 | Prof. Dr. Kamil Can Akçalı | Araştırmacı | AÜKHE |
| 6 | Doç. Dr. Fadime Kıran | Araştırmacı | Ankara Üniversitesi Fen Fak. Biyoloji Bölümü |
| 7 | Dr. Ergül Dilan Çelebi Birand | Araştırmacı | Akerbio Biyoteknoloji A.Ş. |
| 8 | Dr. Erdem Erikçi | Araştırmacı | Akerbio Biyoteknoloji A.Ş. |
| 9 | MSc. Zeynep Büşra Özer | Araştırmacı | AÜKHE |
Yürütücü
ASAUM
Genomik, Biyoinformatik
Yürütücü
ASAUM
Genomik, Biyoinformatik
Araştırmacı
Koç Üniversitesi
Genomik, Transkriptomik, Biyoinformatik
Araştırmacı
Boğaziçi Üniversitesi
Genomik, Transkriptomik
Yürütücü
ASAUM
Genomik, Biyoinformatik
Yürütücü
ASAUM
Genomik, Biyoinformatik
Araştırmacı
Koç Üniversitesi
Genomik, Transkriptomik, Biyoinformatik
Araştırmacı
Boğaziçi Üniversitesi
Genomik, Transkriptomik
Araştırmacı
Koç Üniversitesi
Genomik, Transkriptomik, Biyoinformatik